Tras la polémica, FIFA se rectificó y volvió a reconocerle a Boca dos Intercontinentales
Ante la inminencia del estreno del nuevo Mundial de Clubes, la máxima entidad del fútbol mundial había publicado el listado de los campeones del mundo y había omitido los títulos xeneizes de 2000 y 2003, ante Real Madrid y Milan, respectivamente. Una moción aprobada en 2017 le daba la razón al cuadro de la Ribera.
Si bien en un primer momento la FIFA había declarado cinco ediciones (2000-2004) como "vacantes", luego tuvieron que corregir el artículo y explicar que, en octubre de 2017, se aprobó una moción que reconocía como "campeones del mundo de clubes a todos los equipos europeos y sudamericanos que habían ganado la Copa Intercontinental, disputada entre 1960 y 2004".
La hazaña de Boca contra el Milan, su tercera Intercontinental
En el año 2000 se estrenó el Mundial de Clubes, que tuvo una primera edición inédita con una final entre brasileños: Corinthians venció a Vasco da Gama luego de que Real Madrid quedara eliminado y hasta perdiera por penales el duelo por el tercer puesto ante Necaxa. Ese mismo año 2000, Boca le ganó la final al Real Madrid por 2-1, en la victoria más importante de la historia del club.
Debido a que el Mundial de Clubes no se volvió a jugar hasta 2005, la FIFA consideraba -hasta 2017- que los títulos mundiales de 2001 a 2004 no habían tenido dueño. En ese período, Boca volvió a ganar otra Intercontinental, en 2003, cuando derrotó a Milan por penales tras el 1-1 de los 120 minutos.
Ante el estallido de los hinchas boquenses, y del resto de las instituciones que habían sido marginadas de la lista, el ente situado en Suiza agregó ese párrafo explicativo, que rememora el momento clave del reconocimiento oficial, y editó el padrón con la aparición de Bayern Múnich (2001), Real Madrid (2002), Porto (2004) y el cuadro de la Ribera por duplicado.
El listado de campeones del mundo que publicó la FIFA
- 1960: Real Madrid (ESP)
- 1961: Peñarol (URU)
- 1962: Santos (BRA)
- 1963: Santos (BRA)
- 1964: Inter de Milán (ITA)
- 1965: Inter de Milán (ITA)
- 1966: Peñarol (URU)
- 1967: Racing Club (ARG)
- 1968: Estudiantes (ARG)
- 1969: AC Milan (ITA)
- 1970: Feyenoord (PB)
- 1971: Nacional (URU)
- 1972: Ajax (PB)
- 1973: Independiente (ARG)
- 1974: Atlético de Madrid (ESP)
- 1975: No hubo (no se disputó el partido entre Bayern Munich (ALE) e Independiente (ARG))
- 1976: Bayern Munich (ALE)
- 1977: Boca Juniors (ARG)
- 1978: No hubo (no se disputó el partido entre Boca Juniors (ARG) y Liverpool (ING)
- 1979: Olimpia (PAR)
- 1980: Nacional (URU)
- 1981: Flamengo (BRA)
- 1982: Peñarol (URU)
- 1983: Gremio (BRA)
- 1984: Independiente (ARG)
- 1985: Juventus (ITA)
- 1986: River Plate (ARG)
- 1987: Porto (POR)
- 1988: Nacional (URU)
- 1989: AC Milan (ITA)
- 1990: AC Milan (ITA)
- 1991: Estrella Roja (YUG)
- 1992: São Paulo (BRA)
- 1993: São Paulo (BRA)
- 1994: Vélez Sarsfield (ARG)
- 1995: Ajax (PB)
- 1996: Juventus (ITA)
- 1997: Borussia Dortmund (ALE)
- 1998: Real Madrid (ESP)
- 1999: Manchester United (ING)
- 2000: Corinthians (BRA)
- 2000: Boca Juniors (ARG) - Ganador de la Copa Intercontinental
- 2001: Bayern Munich (ALE)
- 2002: Real Madrid (ESP)
- 2003: Boca Juniors (ARG)
- 2004: Porto (POR)
- 2005: São Paulo (BRA)
- 2006: Internacional (BRA)
- 2007: AC Milan (ITA)
- 2008: Manchester United (ING)
- 2009: Barcelona (ESP)
- 2010: Inter de Milán (ITA)
- 2011: Barcelona (ESP)
- 2012: Corinthians (BRA)
- 2013: Bayern Munich (ALE)
- 2014: Real Madrid (ESP)
- 2015: Barcelona (ESP)
- 2016: Real Madrid (ESP)
- 2017: Real Madrid (ESP)
- 2018: Real Madrid (ESP)
- 2019: Liverpool (ING)
- 2020: Bayern Munich (ALE)
- 2021: Chelsea (ING)
- 2022: Real Madrid (ESP)
- 2023: Manchester City (ING)